Ставьте всегда на активный раздел. Напр.: Стоит 7 на диске С, сделали активным диск D (теперь при загрузке на мониторе увидите "NTLDR is missing", всё правильно, на данном разделе ничего пока нет, а соседние не считаются), поставили на наго XP (XP грузится без проблем, но ничего рядом не видит), сделали опять активным диск С (теперь грузится 7 и тоже ничего рядом не видит), через EasyBCD добавили в меню хрюшу (грузится 7, но теперь видит и XP, можно выбирать). Можно наоборот, разницы нет. 5 минут дополнительно затраченного времени никого не убьёт. Плюсы в том, что ни одна из установленных систем не знает о существовании на соседнем диске ещё кого-то, соответственно не возникает проблем с MBR, активацией и др. Даже если одна из систем умрёт, другая этого не заметит.
P.S. Вообще-то рулит GRUB, но для тех, кто задаёт вопросы в подобных темах это высшая математика.
